Победа в Наваринской битве была очень важной для завоевания независимости Греции. Флот султана был у
Победа в Наваринской битве была очень важной для завоевания независимости Греции. Флот султана был уничтожен, однако он не прекратил военные действия против Греции. 26 апреля 1828г. Россия объявила Турции войну. Российско-турецкая война сковала главные силы турецкой армии, коренным образом изменила военное положение Греции. Началось освобождение захваченных врагом территорий. В октябре войска Ибрагима-паши были вынуждены оставить Морею.
После впечатляющей морской победы россиян, французов и англичан при Наварине, 18 января 1828г. , на российском военном корабле И.Каподистрия вернулся в Грецию, чтоб возглавить борьбу за независимость своей родины.
Греческие войска вели успешные бои в Румелии. Они освободили Воницу, Макронорос, Навпактос и Мессалонги от турецкой армии. 24 сентября этого же года 2.300 греческих воинов во главе с главнокомандующим войсками Восточной Греции Димитрисом Ипсиланти, назначенным И.Каподистрией, разбили при г. Патры пятитысячный турецкий корпус. Битва при Патрах, которую выиграл Димитриос Ипсиланти, стала последней битвой греческой революции за независимость, начатой Александром Ипсиланти.
В результате этой войны удалось решить проблемы на русско-турецком фронте. В борьбе против османского господства греки, первыми из балканских народов, завоевали независимость. По условиям Адрианопольского мирного договора, подписанного Россией и Турцией 14 сентября 1829г. , была признана автономия Греции, а 24 апреля 1830г. – её независимость.
Твёрдая и дальновидная пророссийская политика И.Каподистрии привела к ослаблению Турции и открытию проливов для России. Он начал создавать новое греческое государство в сложных условиях, боролся с сопротивлением тех лиц, которые никому не подчинялись, не поступались клановыми интересами греческих лидеров и за годы революции привыкли полагаться на оружие.
И.Каподистрия организовал госпитали, общеобразовательные и технические школы, военные училища, библиотеки, университет, археологический музей, банки, детские приюты, усовершенствовал законодательство. Он передал землю тем, кто её обрабатывал, решительно боролся с пиратством. При этом сам жил в двухкомнатной квартире, скромно одевался, не получал зарплаты от ещё фактически не созданного государства, тратил на себя, а часто и на государственные потребности, личные средства. Иногда подчинённые заставляли И.Каподистрию надевать его старый русский мундир, чтоб оказывать впечатление на простых людей, которые и без того его любили.
Однако магнаты и судовладельцы, финансовые интересы которых страдали от политики И.Каподистрии, ненавидели его. В 1831г. он был убит при входе в церковь.